Der Kern des heutigen Baus wurde gegen 780 unter Abtbischof
Sintpert (768–791) errichtet. Es handelte sich um eine flachgedeckte Kirche mit mindestens einer
Apsis im Osten, die von einer außenliegenden, gewölbten und noch erhaltenen
Ringkrypta umgeben war. Eine
Konfessio gewährte den Blick aus der Ringkrypta auf das neu geschaffene Grab des Emmeram unter dem Hauptaltar. In der Krypta sind Wandmalereien der Erbauungszeit erhalten. [...]
Gesichert ist der Anbau einer rechteckigen weiteren Außenkrypta im Osten unter Abt
Ramwold um 980. Sie war über zwei Stützen gewölbt, wurde aber in der Barockzeit umgebaut. Dort wurde der Abt im Jahr 1000/1001 in einem Anbau auf der Südseite bestattet. [...]
Um 1050 entstand ein geräumiges Westquerhaus mit
Hallenkrypta, um die Gebeine der Heiligen
Dionysius und
Wolfgang von Regensburg aufzunehmen.